Em 1944 o Guarani sagrou-se campeão amador do interior ao vencer o São Bento de Marília e na sequência tornou-se o primeiro time do interior a conquistar o título de campeão amador do Estado ao bater no Pacaembu o time amador do Palmeiras, campeão da capital.

Em 1947 foi implantado o profissionalismo no interior e em 1948 foi criada a Lei do Acesso. O Guarani conquistou o acesso logo no ano seguinte, ao vencer o Batatais por 2 a 1 em decisão disputada já no início de 1950.

Títulos e Conquistas

1941 – Campeão Campineiro – LCF

1942 – Bicampeão Campineiro – LCF

1943 – Tricampeão Campineiro – LCF

1943 – Vice-campeão Amador do Interior – FPF

1944 – Campeão Amador do Interior – FPF

1944 – Campeão Amador do Estado – FPF

1945 – Campeão Campineiro – LCF

1946 – Vice-campeão Amador do Interior – FPF

1946 – Bicampeão Campineiro – LCF

1949 – Campeão Paulista da 2ª Divisão de Profissionais – FPF